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【科研动态】我室和研究院尚常花副教授在Frontiers in Marine Science 发表海洋微藻巴夫杜氏藻脂质生物合成相关转录因子WRINKLED1-like靶基因的研究成果
2022年2月17日,我室尚常花副教授在Frontiers in Marine Science期刊在线发表题为“Identification of Targets of Transcription Factor WRINKLED1-Like Related to Lipid Biosynthesis From Marine Microalga Dunaliella parva”的研究论文。该论文鉴定了巴夫杜氏藻WRINKLED1-like的靶基因,为深入了解巴夫杜氏藻WRINKLED1-like对脂质合成的调控机制奠定了良好的基础。论文的第一单位为珍稀濒危动植物生态与环境保护教育部重点实验室,尚常花副教授为第一作者和通讯作者,Frontiers in Marine Science 为生物学大类中科院二区期刊。
巴夫杜氏藻是一种单细胞嗜盐绿藻,同时积累脂质和大量类胡萝卜素,对紫外线、盐度升高、极端pH和温度以及氮限制等不利环境条件表现出良好的抗性。大量研究表明WRINKLED1是重要的AP2型转录因子,与脂质积累有关。然而,WRI1-like基因在微藻中(尤其是巴夫杜氏藻)的功能并没有得到很好的阐述。实验室前期的研究表明DpWRI1-like在脂质生物合成的调控中起着重要作用。然而,DpWRI1-like调控的靶基因尚不清楚。通过基因工程方法生产微藻脂质是近年来的一个新兴趋势。因此,在分子水平上研究DpWRI1-like的靶基因具有非常重要的意义,这将为深入了解微藻中脂质生物合成的分子机制,并通过操纵转录因子基因DpWRI1-like的表达来显著提高脂质含量奠定基础。
WRINKLED1是脂质生物合成的关键调控因子。实验室的前期研究构建了参与脂肪酸、TAG和淀粉生物合成和降解的代谢途径,从巴夫杜氏藻中鉴定了DpWRI1-like基因。然而,DpWRI1-like的靶基因尚不清楚。本研究通过ChIP-Seq鉴定DpWRI1-like靶基因,以阐明DpWRI1-like的功能。
研究结果表明,DpWRI1-like的靶基因涉及糖类代谢、脂质代谢、光合作用和转录因子。本研究建立了一个DpWRI1-like调控脂质生物合成的假说。DpWRI1-like调控与糖类代谢相关的靶基因(涉及糖酵解途径、三羧酸循环、淀粉代谢),以促进糖类向脂质的转化。DpWRI1-like调控与脂质代谢相关的靶基因(特别是脂肪酸的生物合成,如KAS基因),以促进脂质的产生。本研究为进一步了解DpWRI1-like对脂质生物合成的调控机制奠定了良好的基础。
图1 研究成果以“Identification of Targets of Transcription Factor WRINKLED1-Like Related to Lipid Biosynthesis From Marine Microalga Dunaliella parva”为题在线发表于Frontiers in Marine Science期刊
图2 DpWRI1-like在巴夫杜氏藻中的部分靶基因
该研究得到了国家自然科学基金(No. 31860010)的资助。论文及补充数据在以下网址可以找到:https://doi.org/10.3389/fmars.2021.807493。
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