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【科研动态】重点实验室田新民教授课题组在《Plant diversity》上发表了枸杞属系统发育基因组学研究成果
枸杞属(Lycium)植物具有重要的药用和经济价值,其跨洲际的间断分布格局、进化历史和属内物种的系统发育关系备受关注。近日,广西漓江流域景观资源保育与可持续利用重点实验室田新民教授课题组联合国内外多家科研单位,在枸杞属系统发育基因组学层面取得了新突破。研究整合了378个单拷贝核基因、线粒体基因组及已发表的质体基因组数据,构建了枸杞属高分辨率的系统发育框架,揭示其生物地理演化历程,探讨不同数据集系统发育关系冲突的成因。
基于单拷贝核基因的物种树明确支持枸杞属为单系,并识别出五个主要分支,其中北美支系最早分化。进一步的研究表明,基于不同数据集的系统发育冲突主要源于历史上的杂交与基因渗入,强烈的基因流动信号和网络模型均证实了这一点;而基因树间的不一致则主要受到不完全谱系分选影响,部分节点峰值超过60%,表明中新世时期发生了快速辐射演化。分化时间估算与祖先分布重建表明,枸杞属起源于北美,于早中新世(约 21.84 Ma)在属内开始分化,随后通过长距离扩散至南美、非洲和欧亚大陆。

Fig. 1. Assessing gene tree conflict and the multispecies coalescent model in Lycium
研究成果以“Phylogenomic conflict in Lycium (Solanaceae): Revealing the roles of hybridization, incomplete lineage sorting, and biogeographic history using nuclear and mitochondrial genomes”为题,发表在中科院一区期刊 《Plant Diversity》上。
重点实验室田新民教授和浙江大学李攀副教授为共同通讯作者,已毕业博士生古丽巴哈尔为第一作者。重点实验室硕士研究生高玉竹、韦钻参与了部分工作。奥地利萨尔茨堡大学的Hans Peter Comes教授和美国迈阿密大学的李峥教授对论文进行了指导和修改。本研究获得了国家自然科学基金、中央引导地方发展资金的资助。
全文链接:https://doi.org/10.1016/j.pld.2026.02.005

(图文/田新民 一审/莫燕华 二审/万祎 三审/马姜明)
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