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【科研动态】重点实验室宋钰教授课题组发布安龙油果樟细胞器基因组图谱,揭示了油果樟属系统发育新框架
樟科(Lauraceae)厚壳桂族(Cryptocaryeae)包含约12属850种,是典型的热带起源类群。在我国广西壮族自治区,该族中油果樟属(Syndiclis)、厚壳桂属(Cryptocarya)及琼楠属(Beilschmiedia)均有自然分布。其中,油果樟属在我国记录近10种,但种间系统发育关系尚不明确。近期,广西漓江流域景观资源保育与可持续利用重点实验室(以下简称“重点实验室”)宋钰教授课题组与越南林科院的研究人员合作,在油果樟属系统学研究中取得了新进展。

图1 安龙油果樟粒体基因组和叶绿体基因组物理图谱
课题组首先完成了安龙油果樟(Syndiclis anlungensis)完整的线粒体基因组(mtDNA)和叶绿体基因组(cpDNA)的测序和组装,其长度分别为2,368,454 bp和158,571 bp。在线粒体基因组中,共鉴定出1,317个重复序列和698个简单重复序列(SSR)。同时,线粒体与叶绿体基因组之间检测到65个同源DNA片段,提示两者间可能存在频繁的遗传信息交流。基因同线性分析表明,与其它樟目测序物种——包括莲叶桐(Hernandia nymphaeifolia)、广东厚壳桂(Cryptocarya kwangtungensis)、小花檬果樟(Caryodaphnopsis henryi)——之间存在广泛的线粒体基因重排现象,仅发现5个保守基因簇,即sdh4-cox3-atp8, rps12-nad3, rpl16-rps3, rpl5-rps14-cob和atp4-nad4L。基于线粒体基因组41个编码基因序列矩阵重建的系统发育树显示,仅分布于亚洲的11种油果樟属林木可聚为两个主要分支:一支包含广西油果樟、香港油果樟、鳞秕油果樟等6个物种,另一支则由安龙油果樟、油果樟、乐东油果樟、麻栗坡油果樟等5个物种组成(图2)。

图2 基于线粒体基因组序列构建油果樟属植物的系统发育关系
上述研究成果以“The large mitochondrial genome of Syndiclis anlungensis (Lauraceae): Genome structure, comparative analysis, and phylogenetic relationships among Syndiclis species”为题,在线发表于国际分子生物学领域期刊《Genomics》。重点实验室硕士应届毕业生马举蓉为该论文第一作者,宋钰教授担任通讯作者。本研究得到广西科技基地和人才专项(桂科AD23026281)及国家自然科学基金(32260060)的联合资助。
(图文/马举蓉 一审/宋钰 二审/莫燕华 三审/马姜明)
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